国家棉花种质中期库依托于365bet体育在线主页，1979年始建。目前所用种质库为2001年重建，2002年投入使用，设计库温为0℃±2℃，相对湿度50%±7%，库房面积50m²，库容1万份，种子可安全保存15年。2011年6月又建成一座集干燥、冷藏于一体的现代化种质库，库房面积300m²，库容5万份，即将投入使用。
    截至2010年12月，国家棉花种质中期库共保存来自世界53个产棉国棉花种质资源8868份，其中陆地棉7362份、陆地棉野生种系350份、海岛棉633份、亚洲棉433份、草棉18份、野生种32份，保存数量居世界第4位。
    国家棉花种质中期库的方向和任务是：按照国家棉花生产和科研的要求，有计划的收集国内外棉花种质资源，经过鉴定评价，繁殖保存入库，保证库内种质的发芽率和遗传完整性，提供全国棉花育种、应用研究和基础研究利用。棉花种质资源的应用领域涉及耕作栽培、生理生化、遗传育种、基因定位、基因克隆、功能基因组学、蛋白质组学等，甚至涉及检验、检疫、医学、环境等学科，在我国棉花科研发展过程中起着强有力的支撑作用。2001-2010年，国家棉花种质中期库共向704人次提供11507份次棉花种质，年均1150份次，为棉花国家重点基础研究发展计划如863、973等项目提供基础材料600余份次。