本发明涉及筛选高抗盐碱半野生棉材料的方法，所述方法包括步骤：(1)采用0.4%浓度的Nacl对半野生棉自然群体在温室进行苗期砂培耐盐性鉴定，初步筛选抗性以上的半野生棉材料。(2)将选出的高抗或抗盐(Nacl)材料在新疆中度发生的次生盐碱地进行实生境鉴定、筛选，将高盐碱选择压力下存活的植株移植到海南，进行自交，单株分收、分轧；再分株种植，自交，形成高抗株系。(3)进入“新疆盐碱地鉴定-高压选择-高抗植株移至海南-高抗株系”的程序，如此循环3次，最终从半野生棉自然群体中筛选到稳定可靠的高抗盐碱材料。